审计终结阶段是指实施阶段结束以后，审计人员根据审计工作底稿编制审计报告，并将有关文件整理归档的全过程。在国家审计中，审计的终结阶段还包括做出审计结论和决定。
（一）编制审计报告
审计人员在完成外勤审计工作以后，就开始进入编制审计报告的阶段，此阶段的主要工作有：整理、评价执行审计业务中收集到的审计证据；复核审计工作底稿；审计期后事项；汇总审计差异；提请被审计单位调整或做适当批露；形成审计意见，撰写审计报告。
 
（二）作出审计结论和决定
国家审计机关对被审计单位进行审查，如果发现存在严重违法乱纪问题，在签发审计报告时，要做出审计结论和处理决定，责成被审计单位遵照执行，并通知财政、税务、银行等有关部门协助执行。对有关责任人员，审计机关应向其领导部门提出给予纪律处分的建议或移交有关部门处理。
审计机关在征求有关部门意见后，应依法独立做出审计结论和处理决定。审计结论和处理决定具有法律效力，一经下达，被审计单位必须执行。
 
（三）审计资料的整理归档
终结阶段的最后一项工作是对有关审计资料和文件的清理归档工作。审计人员应将向被审计单位调阅的资料全部归还给被审计单位。对审计过程中积累的大量资料进行清理，将保存价值不大的资料剔除后销毁，并将需要保存的资料编号后送交档案部门归档保管。至此，该项审计工作基本结束。