（一）审计档案的作用和分类
审计档案的作用主要有以下方面：
1、为审计结束后进行查考提供依据。
2、为审计工作规范化积累资料。
3、为下一次审计工作提供情况。
1、  为审计理论研究提供素材。
审计档案按其使用期限的长短和作用的大小可以分为永久性档案和当期档案。
（二）审计档案的整理和归档
审计工作结束以后，审计人员要对审计过程所获取或形成的资料进行分类整理并归档。
对于国家审计机关而言，审计档案资料分类整理完毕后，应将审计档案送交档案部门统一管理，归档时应办理必要的归档手续。一般的审计档案由审计机关自行保管，重要的审计案件的档案应送交国家档案部门保管，但审计机关应复制副本，由审计机关保存。
对于社会审计组织而言，审计档案的所有权属于承接该项业务的会计师事务所。会计师事务所应建立审计档案保管制度，以确保审计档案的安全、完整。其中，当期档案自审计报告签发之日起至少保存十年；永久档案应长期保存；不再继续审计的被审计单位，永久性档案的保管期限与最近一年当期档案的保管期限相同。对于保管年限届满的审计档案，会计师事务所可以决定将其销毁。销毁时，应当按照规定履行必要的手续。
 
（三）审计档案的保管与查阅
审计机构及有关部门除了应当妥善保管审计档案，还应建立审计档案的保密制度，对审计档案中涉及的商业秘密保密。
对于国家审计机关所保存的审计档案一般不宜向外公开，在一定期限内审计档案仅供审计机关人员调阅。有关方面调阅审计档案，要经过审批，并做好借阅记录。
对于社会审计而言，会计师事务所只有在一些特殊情况下允许查阅审计档案，而不属于泄密。查阅者因误用审计工作底稿而造成的后果，与拥有审计工作底稿的会计师事务所无关。